Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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