Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPN13Q12923 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPN13Q12923 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPN13Q12923 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPN13Q12923 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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