Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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VAX2Q9UIW0 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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VAX2Q9UIW0 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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VAX2Q9UIW0 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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VAX2Q9UIW0 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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VAX2Q9UIW0 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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VAX2Q9UIW0 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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