Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3M2P53677 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms