Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms