Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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