Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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