Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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