Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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