Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms