Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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