Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNA5SP459-201ENST00000516628 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 CDKN2B-AS1-203ENST00000428597 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 AC026746.1-201ENST00000505623 2105 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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