Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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