Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms