Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 FXYD5-203ENST00000392218 763 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PRH2-202ENST00000396400 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC244098.1-201ENST00000436499 275 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MT1JP-201ENST00000444023 186 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC073254.1-202ENST00000447488 640 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GAPDHP45-201ENST00000452090 349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL357874.2-201ENST00000457044 679 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RN7SL762P-201ENST00000469864 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC004828.1-201ENST00000555303 654 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.121-201ENST00000578843 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RN7SL620P-201ENST00000610816 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.197-201ENST00000618956 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RN7SL627P-201ENST00000620534 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MAPK10-368ENST00000641911 2238 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MAP3K14-202ENST00000376926 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ANKRD20A2-201ENST00000377601 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MAP3K7CL-202ENST00000339024 2066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MAP3K7CL-208ENST00000399935 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZNF417-201ENST00000312026 3597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PCDHAC1-202ENST00000409700 4077 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 BMPR1B-208ENST00000515059 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 THPO-201ENST00000204615 1855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TTC31-202ENST00000410003 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TOX4P1-201ENST00000514955 1862 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 OTUB2-201ENST00000203664 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 ZNF835-201ENST00000537055 3450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZER1-201ENST00000291900 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 LINC02254-201ENST00000558621 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ANKRD42-204ENST00000526731 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TRBV5-6-201ENST00000390375 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 Metazoa_SRP.74-201ENST00000614973 284 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 AC020658.5-201ENST00000622487 442 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DHX8-201ENST00000262415 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TIAM2-210ENST00000528391 3349 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 LAMB3-203ENST00000391911 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DDX3P3-201ENST00000506389 1994 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GTF2H2B-204ENST00000513202 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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