Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms