Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms