Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms