Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
GAPVD1Q14C86 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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