Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms