Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPN13Q12923 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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