Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
APOBRQ0VD83 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
APOBRQ0VD83 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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