Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTPREP23469 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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