Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GY48 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GY48 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GY48 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
V9GY48 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
V9GY48 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GY48 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GY48 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms