Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms