Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms