Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
RAD54L2Q9Y4B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD54L2Q9Y4B4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD54L2Q9Y4B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms