Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms