Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms