Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1RE1Q9UN81 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms