Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO5BQ9ULV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO5BQ9ULV0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms