Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN1Q9ULB1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN1Q9ULB1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms