Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH13Q9UKX3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms