Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms