Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNL1Q9UK58 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms