Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA1Q9UIW2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms