Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms