Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5BQ9UGL1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms