Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD5Q9P267 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms