Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIS18AQ9NYP9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms