Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms