Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DLL3Q9NYJ7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms