Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms