Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH4Q9NXW9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms