Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM248Q9NWD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms