Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 528.53■■■□□ 2.164e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 328.06■■■□□ 2.084e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 328.06■■■□□ 2.084e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.574e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 224.56■■□□□ 1.524e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-249ENST00000490374 675 ntTSL 323.28■■□□□ 1.324e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 322.8■■□□□ 1.244e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 222.8■■□□□ 1.244e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-206ENST00000349036 581 ntTSL 520.89■□□□□ 0.934e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-219ENST00000453292 632 ntTSL 519.97■□□□□ 0.794e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-247ENST00000488546 897 ntTSL 518.6■□□□□ 0.574e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 518.59■□□□□ 0.574e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.554e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-252ENST00000493744 812 ntTSL 218.42■□□□□ 0.544e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-239ENST00000481039 756 ntTSL 518.4■□□□□ 0.544e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-205ENST00000338783 641 ntTSL 317.85■□□□□ 0.454e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 317.85■□□□□ 0.454e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 316.32■□□□□ 0.24e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.14e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 515.5■□□□□ 0.074e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-16■■■□□ 16.9
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DROSHAQ9NRR4 GNAS-251ENST00000492907 790 ntTSL 313.67□□□□□ -0.224e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 312.25□□□□□ -0.454e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.144e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RELT-206ENST00000545687 586 ntTSL 434.73■■■■□ 3.157e-7■■■□□ 16.9
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DROSHAQ9NRR4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.121e-7■■■□□ 16.9
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DROSHAQ9NRR4 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 423.91■■□□□ 1.423e-7■■■□□ 16.9
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DROSHAQ9NRR4 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 16.8
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DROSHAQ9NRR4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-212ENST00000419843 400 ntTSL 332.36■■■□□ 2.773e-7■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.23e-7■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 KAT2B-202ENST00000426228 571 ntTSL 47.96□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 16.8
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DROSHAQ9NRR4 UBALD2-202ENST00000587913 286 ntTSL 318.26■□□□□ 0.517e-10■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)27.52■■■□□ 27e-7■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 220.58■□□□□ 0.897e-7■■■□□ 16.8
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DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 58.79□□□□□ -16e-8■■■□□ 16.8
DROSHAQ9NRR4 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 239.75■■■■□ 3.952e-7■■■□□ 16.8
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DROSHAQ9NRR4 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 233.42■■■□□ 2.942e-17■■■□□ 16.8
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DROSHAQ9NRR4 CLASRP-205ENST00000585432 290 ntTSL 226.39■■□□□ 1.822e-6■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CLASRP-206ENST00000585615 633 ntTSL 223.39■■□□□ 1.332e-6■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 16.7
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DROSHAQ9NRR4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.294e-9■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.224e-9■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 341.08■■■■■ 4.174e-9■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CCM2-203ENST00000461377 1983 ntTSL 530.07■■■□□ 2.44e-9■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 529.48■■■□□ 2.314e-9■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.382e-7■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.234e-7■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.534e-7■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.176e-7■■■□□ 16.7
DROSHAQ9NRR4 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 215.07■□□□□ 01e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NAMPT-209ENST00000484527 833 ntTSL 320.4■□□□□ 0.863e-11■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 536.09■■■■□ 3.371e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.751e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.421e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 246.77■■■■■ 5.082e-20■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 242.39■■■■■ 4.382e-20■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.972e-20■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 339.75■■■■□ 3.955e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.712e-20■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 228.17■■■□□ 2.16e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.046e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.246e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-210ENST00000525223 610 ntTSL 321.82■■□□□ 1.086e-9■■■□□ 16.6
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