Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDHAF3Q9NRP4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms