Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL1Q9NR64 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL1Q9NR64 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms