Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GLB2Q9NR46 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms