Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms